Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufs4Q9CXZ1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufs4Q9CXZ1 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms