Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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