Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ttc39cQ8VE09 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc39cQ8VE09 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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