Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Pramef8Q8CE24 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Pramef8Q8CE24 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pramef8Q8CE24 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pramef8Q8CE24 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms