Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc187Q8C5V8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms