Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cwc22Q8C5N3 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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