Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc21aQ8C0S4 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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