Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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