Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Htatsf1Q8BGC0 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms