Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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