Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms