Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AtminQ6P9S1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms