Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms