Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Trp63-206ENSMUST00000115307 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29444-201ENSMUST00000187152 1156 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 4933417G07Rik-201ENSMUST00000199681 1137 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms