Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms