Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms