Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms