Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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