Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Psph-202ENSMUST00000118268 785 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 4930579M01Rik-201ENSMUST00000130943 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mobp-201ENSMUST00000068698 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms