Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dnmt3cP0DOY1 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dnmt3cP0DOY1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms