Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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PtprqP0C5E4 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprqP0C5E4 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms