Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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