Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Mbd3Q9Z2D8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd3Q9Z2D8 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms