Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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