Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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