Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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