Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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