Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms