Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rad54bQ6PFE3 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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