Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Fam71bQ5STT6 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Fam71bQ5STT6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fam71bQ5STT6 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Fam71bQ5STT6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam71bQ5STT6 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fam71bQ5STT6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam71bQ5STT6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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