Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Plekho2-201ENSMUST00000068944 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp189-201ENSMUST00000042964 2835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 AC113125.1-201ENSMUST00000226852 1774 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc12-201ENSMUST00000048067 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms