Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Trp53i11Q4QQM4 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Trp53i11Q4QQM4 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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