Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Otud5Q3U2S4 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms