Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms