Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr1bP70700 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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