Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkn1P70268 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms