Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SbdsP70122 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms