Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Sh3bp1P55194 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC158238.1-201ENSMUST00000216899 1965 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms