Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtpreP49446 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtpreP49446 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtpreP49446 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtpreP49446 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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