Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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