Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cd28P31041 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms