Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6348-201ENSMUST00000200751 1443 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6346-201ENSMUST00000201146 1443 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 2610001J05Rik-204ENSMUST00000185361 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm43079-201ENSMUST00000199794 559 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms