Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Slc1a6O35544 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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