Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc8E9PWG2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms