Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col4a6B1AVK5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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