Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprfA2A8L5 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprfA2A8L5 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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