Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms