Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms