Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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