Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Stx12-201ENSMUST00000030698 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms